Muwajjah adalah salah satu kegiatan belajar mengajar yang dilakukan diluar jam sekolah dengan tujuan untuk meningkatkan kualitas akademik santri. Muwajjah juga biasa disebut dengan les (pelajaran tambahan di luar jam sekolah).

Namun, hingga saat ini muwajjah sudah dijadikan kegiatan belajar mengajar yang tetap, meskipun diluar jam sekolah kegiatan ini tetap dilakukan dengan tertib seperti pada jam sekolah umumnya dan sekarang kegiatan ini sudah dimasukkan sebagai jam pelajaran ke 7 dalam kegiatan belajar mengajar di Pondok Pesantren Nurul Bayan. Biasanya di Pondok Pesantren Nurul Bayan kegiatan ini dilakukan pada sore hari, namun karena adanya evaluasi-evaluasi tertentu sehingga disediakan waktu yang khusus agar para guru terlebih lagi santri dapat memiliki lebih banyak waktu untuk belajar.

Tujuan kegiatan ini dilakukan adalah untuk lebih meningkatkan kualitas akademik santri dan memberikan santri waktu lebih luang untuk memperdalam materi pelajaran selain pada waktu sekolah pagi. karena sesungguhnya salah satu syarat kita dapat memperoleh ilmu itu yakni memiliki waktu yang panjang (thulu zamanin).

Muwajjah malam ini juga merupakan salah satu usaha alternatif agar kualitas santri menjadi lebih baik dan tentunya dengan bimbingan yang baik dan disertai pengontrolan yang kuat juga (keistiqomahan). Bukan hanya santri, namun para guru juga dapat mengambil manfaat dari program muwajjah malam ini. Tidak lain tujuan diadakan semua program-program di pondok adalah semata hanya untuk melahirkan pemimpin-pemimpin Islam yang berkarakter sebagai bentuk khidmatul ummah.